What is whole exome sequencing?

Whole exome sequencing (WES) reads all protein-coding regions of the genome — about 20,000 genes. These regions (the 'exome') make up roughly 1–2% of the total DNA but contain about 85% of known disease-causing variants, making WES the highest-yield general test for inherited disease.

How is WES different from WGS?

WGS (whole genome sequencing) reads the entire genome, including non-coding regions. WES focuses only on the coding regions. WES is faster, less expensive, and yields the majority of clinically relevant findings — WGS is used when non-coding variants are specifically suspected.

How is WES different from a gene panel?

A gene panel tests a fixed set of pre-selected genes (usually 50–500). WES tests all ~20,000 genes without preselection — so it can detect rare or unexpected variants that panels miss.

Single-nucleotide variants and small insertions/deletions in coding regions and adjacent splice sites. Most known Mendelian (single-gene) inherited diseases fall into this category — including nearly all conditions relevant to premarital carrier screening.

What can WES not detect?

Large structural variants (big duplications or deletions), deep intronic variants far from coding regions, trinucleotide repeat expansions (like Huntington's or fragile X), and mitochondrial DNA (unless a mitochondrial panel is added). For these, targeted tests are used.

Modern clinical-grade WES achieves >99% accuracy for single-nucleotide variants in well-covered coding regions. NAWA uses NGS platforms with minimum 100x coverage across the medical exome and every reported variant is reviewed by three specialist physicians before results are released.

العلم

تحليل الإكسوم الكامل (WES) — بشرح واضح.

الإكسوم هو 1–2% من حمضك النووي الذي يصنع البروتينات — وفيه ~85% من الطفرات المسبّبة للأمراض المعروفة. لهذا يُعدّ WES المعيار الذهبي للفحص الوراثي العام.

~20,000 جين مشفّر للبروتينات
يكشف 85% من الطفرات المسبّبة
أسرع وأرخص من الجينوم الكامل
التقنية التي تستخدمها نواة

افهموا الإكسوم

الجينوم مقابل الإكسوم مقابل الجين — ثلاث مستويات.

الجينوم

كل الـ 3 مليار قاعدة نووية. تشمل المناطق المشفّرة (الإكسونات)، غير المشفّرة (الإنترونات)، ومناطق التنظيم. WGS يقراها كلها.

الإكسوم

المناطق المشفّرة للبروتينات فقط — إكسونات الـ 20,000 جين. ~1–2% من الجينوم، لكنها موطن أغلب الطفرات المسبّبة.

الجين

مقطع واحد من الحمض النووي يشفّر بروتين واحد. لوحة الجينات تستهدف مجموعة محدّدة؛ WES يستهدفها كلها مرّة واحدة.

قارنوا

WES مقابل WGS ومقابل لوحات الجينات.

الميزة

لوحة جينات

WES (نواة)

الجينات المفحوصة

50–500

أكثر من 20,000 (كل المشفّرة)

يكشف طفرات غير متوقّعة

قابل لإعادة التحليل مع تقدّم العلم

مدّة النتيجة

2–4 أسابيع

6–8 أسابيع

التكلفة

أقل

متوسّطة

الأنسب للفحص قبل الزواج

محدود

WGS يغطّي مساحة أكبر لكن بتكلفة 3–5 أضعاف، ومدّة أطول، وإفادة إكلينيكية إضافية محدودة مقارنة بـ WES لأغراض ما قبل الزواج. نواة يوفّر WGS عند الطلب عندما يكون مناسبًا إكلينيكيًا.

كيف نواة يشغّل WES

تسلسل بجودة إكلينيكية، ومراجعة ثلاث أطباء.

تغطية 100x أو أعلى

كل منطقة تُذكر في التقرير مسلسلة بـ 100 قراءة مستقلّة على الأقل. هذا العمق المطلوب لثقة إكلينيكية.

تصنيف ACMG

الطفرات تُصنَّف حسب معايير الكلّية الأمريكية للوراثة الطبية — مسبّبة، على الأرجح مسبّبة، غير محدّدة، على الأرجح حميدة، حميدة.

مراجعة 3 متخصّصين

يراجع كل طفرة تُذكر ثلاثة أطباء متخصّصين بشكل مستقل. لا تصل أي نتيجة آلية غير مراجَعة إلى التقرير النهائي.

أسئلة متكرّرة

أسئلة شائعة عن WES.

ما هو تسلسل الإكسوم الكامل؟

تسلسل الإكسوم الكامل (WES) يقرأ جميع المناطق المشفّرة للبروتينات في الجينوم — نحو 20,000 جين. تشكّل هذه المناطق (الإكسوم) نسبة 1–2% من الحمض النووي، لكنها تحتوي على 85% من الطفرات المعروفة المسبّبة للأمراض، ما يجعله أعلى فحص عام فائدة للأمراض الوراثية.

ما الفرق بين WES و WGS؟

WGS (تسلسل الجينوم الكامل) يقرأ الجينوم بأكمله، بما في ذلك المناطق غير المشفّرة، بينما يركّز WES على المناطق المشفّرة فقط. وهو أسرع وأقل تكلفة ويقدّم معظم النتائج السريرية المهمّة — بينما يُستخدم WGS عند وجود اشتباه محدّد في متغيّرات غير مشفّرة.

ما الفرق بين WES ولوحة الجينات؟

تفحص لوحة الجينات عددًا ثابتًا من الجينات المختارة مسبقًا (50–500 عادةً)، بينما يفحص WES جميع الجينات الـ20,000 دون اختيار مسبق — ويمكنه اكتشاف طفرات نادرة أو غير متوقّعة لا تكتشفها اللوحات.

ما الذي يستطيع WES اكتشافه؟

التغيّرات في نوكليوتيد واحد، والإدخالات أو الحذوفات الصغيرة في المناطق المشفّرة ومناطق الوصل المجاورة. تندرج معظم الأمراض الوراثية الأحادية الجين ضمن هذه الفئة — بما في ذلك كل ما يهم فحص الحاملين قبل الزواج.

ما الذي لا يستطيع WES اكتشافه؟

المتغيّرات الهيكلية الكبيرة (التكرارات أو الحذوفات الكبيرة)، والمتغيّرات العميقة داخل الإنترونات، وتوسّعات التكرار الثلاثي (مثل هنتنغتون أو متلازمة الكروموسوم X الهش)، والحمض النووي الميتوكوندري (ما لم تُضَف لوحة خاصة). ولهذه الحالات تُستخدم فحوصات موجّهة.

ما مدى دقّة WES؟

يحقّق WES السريري الحديث دقّة تفوق 99% للمتغيّرات أحادية النوكليوتيد في المناطق جيدة التغطية. تستخدم نواة منصّات NGS بتغطية لا تقل عن 100x عبر الإكسوم الطبي، وتتم مراجعة كل طفرة تُذكر في التقرير من قبل ثلاثة أطباء متخصّصين قبل إصدار النتيجة.